1、用药时机把握不准。打药务必抓住时机，只有了解病虫所发生的规律，适时用药，方能奏效。例如治螟虫必须在卵孵高峰期用药，如果等到蚁螟已蛀入茎秆，出现了枯心、白穗、死穗等再来用药，肯定防效不佳。
2、施药方法不当。田间病虫的发生、危害和栖息在作物上都有一个危害部位，这个特定的部位，便是我们农药这支箭应该射中的靶。射不中靶，农药防效就差。如防治螟虫要对准心叶喷药，防治稻飞叶喷药，防治稻飞虱和纹枯病要对着稻株下部喷药，稻纵卷叶螟、叶稻瘟、白叶枯病等要向上部叶片喷药。
3、病虫抗性不断增加。病菌和害虫对农药的抗性，是当今阻碍农药充分发挥应有防治效果和潜在效能的现实问题。随着杀虫剂用量的迅速增加和品种的不断更替，病虫抗药性日趋加剧。特别是粮、油、菜、茶、果等到主要作物，用药频繁的重大病虫的种类，其抗药性更是几倍、几十倍的增加。
4、不懂技术，防治对象不明确。病当虫打，虫当病杀，草做虫除，这首先是诊断错误，判别不清，导致错误用药，防治不佳甚至产生药害。如棉花现蕾后发生的红叶枯死病，叶脉变绿，叶肉紫红，呈猪肝色，叶片向下反卷，终焦枯脱落，人们容易误认为是红蜘蛛危害；大豆田杂草菟丝子危害，导致大豆生长停滞，发育不良，误当成根结线虫病来治等等，当然是越治越严重。
5、喷施药液浪费大。目前我国农村普遍使用的喷药器具，仍然是几十年一贯制的工农—16型喷雾方法，费劳力、浪费大、易中毒、不安全、雾粒粗、防效差。据测定，这种喷雾法，粘着性差，沉积率低，其中70%—90%的药液白白浪费了，滴落在土壤里，流失在水域中，而且严重地污染了环境。所以应积极推广低容量喷雾、超低量喷雾、弥雾、静电喷雾等新的机具和技术，这是解决防治不佳减少浪费的有效途径。
6、农药自身防效的局限。有些农药以某些病虫有良好的防治效果，但对另一些病虫却无能为力，防效极差。如三唑磷对稻螟、棉铃虫和其它鳞翅目类害虫防效都较好，而且对这些害虫有明显的杀卵作用，但它却能刺激稻飞虱产卵，导致稻飞虱再度猖獗等等。
7、施药时间未把握好。昆虫的活支受日夜交替规律的支配，也有自己的“生物钟”，如菜粉蝶（菜青虫成虫）、棉大卷叶蛾、稻蝗等都喜欢在光照充足白天活动，而鳞翅目夜蛾和部分螟蛾科害虫，都在晚上活动、交配、产卵危害动物。因此，我们应掌握害虫的活动规律，在一天中，分别不同时间，有针对性地“按时服药”，才能达到佳效果。
8、天气条件的制约。不同的气象条件与农药的防治效果息息相关，不同的温度、湿度、光照、风力、阴晴等对病虫的发生、活动规律和防治效果都有影响。如气温在8℃以下，除草剂不易发挥药效；35℃以上高温和强烈光照，化学农药易蒸发散失；风大药液飘移、吹散，也影响防效。施用乳油剂型农药，喷药时要求24小时内无雨；施用触杀性农药时要求48小时内无雨。
9、天敌的减少。由于连年大量施用剧毒、高残留农药，害虫的天敌受极大的杀伤，生态平衡受到破坏，导致害虫再度猖獗，形成了恶性循环。
10、对药水质的原因。水有硬水和软水之分，井水、矿区水、某些山区的泉水多为硬水，稀释农药效果差，因内含矿物质，会分解农药的有效成分；而塘水、河水、溪流水多为软水，矿物质含量少，稀释农药效果好。但这些塘水、河水如很浑浊，也会影响药效的发挥。