农药与医药，两者都是“药”。它们有不少相通性，但也有很大区别。虽然此2种“药”都有除害、医病的功能，但医药品针对的是“人”，而农药则主要针对植物。它们同样都是保护生物，均为保护生物免受各种害物侵害。
    由于医药品直接对“人”，故更为人们所关注，人们对医药品的投入大大高于农药，而产生的销售额也远高于农药。2013年，全球位列前10位的医药公司的销售额共为3459亿美元；而位列前10位农药公司的销售市场共为519.97亿美元。两者相差6.66倍。而位居医药公司首位的诺华公司2013年销售市场为505亿美元，是同年位列农药公司第1位先正达公司114.13亿美元的4.42倍。一个诺华公司的销售额几乎是全球农药市场和总和。同时，位列2013年全球医药公司第10位的依礼·礼来公司的销售额为230亿美元，为2013年列农药公司第10位富美实公司17.64亿美元的13.04倍。
    鉴于医药品直接对人，而农药的对象为植物，故医药更受人注意。医药是个体的行为，农药是群体的行为，为此更引人注目。也就是说，医药接触的为某个或部分人，而农药则与全球队每个人有都有关。所以人们对农药在环境中的生态要求更高，同时也会使人们更易造成误解。
有不少人认为，医药品是治疗人的，故是安全的；而农药（特别是杀虫剂），因为是“杀死”害虫的，故认为都是毒的。事实上，很多医药品的毒性远高于农药，下表为近年上市热点农药品种与常用医药品毒性比较。

        近年新上市热点农药与常用医药品的毒性比较             
                     医药品或农药                   急性经口毒性LD50/(mg·kg-1)
农药             氟啶嘧磺隆（除草剂）                    >2000
                  碘甲磺隆（除草剂）                       >2678
                  双氟磺草胺（除草剂）                    >6000
                  硝磺草酮（除草剂）                       >5000
                  氯虫苯甲酰胺（杀虫剂）                  >5000
                  乙基多杀菌素（杀虫剂）                  >5000
                  噻虫嗪（杀虫剂）                           1563
                  螺虫乙酯（杀虫剂）                        >2000
                  茚虫威（杀虫剂）                           1732
                  氰氟虫腙（杀虫剂）                        >5000
                  嘧菌酯（杀菌剂）                           >5000
                  吡唑醚菌酯（杀菌剂）                      >5000
                  丙硫菌唑（杀菌剂）                         >6200
                  氟环唑（杀菌剂）                            >5000
                  啶酰菌胺（杀菌剂）                         >5000
                  噁唑菌酮（杀菌剂）                         >5000
                  医药品   洋地黄（强心剂）                  0.4
                  秋水仙碱（消炎剂）                          1.7
                  阿司匹林（解热剂）                          400
                  吗啡（镇静剂）                             120-250
     另外，当今世界卫生组织对农药的审查也远比医药品严格。对于医药品主要要求进行对人及其相关器官及生殖、遗传等安全性试验及毒性毒性试验。而对于农药，不仅要进行与医药品相同的毒性试验，还必须进行对蜂、鸟、鱼、蚕及土壤生物、水生生物和天敌、益虫等众多的安全性试验，同时，还必须提供药剂代谢物对环境影响的数据。此外，还要求尽力避免水、光等环境因素对其影响。再有，任何药物要加工成各种制剂，以能方便使用。而农药的加工比医药品难度更高，农药必须将少量的药剂（通常667m2的田为几克-几十克）均匀分布在广阔的农田中，故要求更高。农药的制剂加工对时间、场所、传送需求量等的理念与要求与医药品有大不同，特别是传送系统。下图为农药传送系统（Pesticide Delivery Ststem,PDS)与医药品传送系统(Drug Delivery System,DDS)的比较。

                              农药与医药品传送系统的比较                
                    PDS                                        DDS            
对象状态        开放体系                                 封闭体系
环境条件         变化大                                   固有（体内）
材料、技术   不得使用高价材料                         可使用高价材料
传送媒介           无                                      有（血液、体液）
对环境影响       有                                          无           
      总之，对于医药品，以治病救人为根本，而对于农药则以保证生态环境健康、确保粮食收成为目的。故而，如今对农药的要求为减轻环境负荷、降低空中飘移、减少对水系及地下水的影响。
      同时，人们在农药开发中也汲取了不少医药上适用的新技术，在农药研发中得以应用。如目前在农药研发中广泛应用的通过计算机进行构效关系（QSAR）技术，以及医药设计中的虚拟设计（in silico)也在农药研发中得以运用。新医药品的开发成为新农药开发的钥匙，是很好的借鉴。